254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5080 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  70.98 
 
 
224 aa  291  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  53.92 
 
 
220 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.3 
 
 
233 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.51 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  46.55 
 
 
226 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  42.73 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  41.85 
 
 
225 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.41 
 
 
221 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  41.4 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  38.35 
 
 
213 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  39.22 
 
 
258 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  39.39 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  41.18 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  38.03 
 
 
222 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.82 
 
 
213 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  37.28 
 
 
241 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.06 
 
 
232 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.77 
 
 
233 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  38.78 
 
 
213 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.15 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  38.27 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  38.27 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  37.76 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  38.69 
 
 
216 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.36 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  36.22 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.98 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  32.28 
 
 
203 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.37 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.99 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.03 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.52 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  32.74 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  50.55 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  30.37 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.26 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  38.26 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  33.82 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.36 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  36.84 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  30.88 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  35.16 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.21 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.17 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.17 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  37.84 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.69 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.69 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.69 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.69 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  30.69 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.69 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  30.2 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  36.26 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.84 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 
812 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  42.64 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.85 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  34.39 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  33.55 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  31.66 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  31.82 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  42.42 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  31.3 
 
 
805 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  37.39 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  31.31 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 
828 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  32.85 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.05 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  32.5 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  33.51 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.77 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  30.41 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.65 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.32 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  32.82 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.13 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  31.75 
 
 
216 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  32.31 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.31 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.31 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25.79 
 
 
843 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  25.79 
 
 
835 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>