More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4463 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  94.14 
 
 		 222 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  81.08 
 
 		 222 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  78.38 
 
 		 222 aa  363  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  78.38 
 
 		 222 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  77.93 
 
 		 221 aa  359  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  69.96 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  67.41 
 
 		 224 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  67.41 
 
 		 224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  65.32 
 
 		 222 aa  307  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  67.41 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  64.73 
 
 		 224 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  66.52 
 
 		 224 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  65.78 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  63.51 
 
 		 219 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  59.36 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  58.9 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  60.09 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.86 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  57.01 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.88 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  56.56 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  55.41 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  55 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  49.29 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  48.58 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  53.85 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  41.78 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  50 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  48.13 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  49.28 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.28 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.28 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.05 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.98 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  46.6 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.62 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  39.73 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.29 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  39.3 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  39.69 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.87 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  41.12 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  41.9 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  43.14 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  33.64 
 
 		 828 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 835 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 843 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 835 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  33.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.56 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.96 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.39 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.8 
 
 		 812 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  32.12 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.64 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.63 
 
 		 833 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  39.09 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  35.19 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.8 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 808 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.21 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  38.14 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.86 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.21 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  34.58 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.44 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  34.58 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  23.65 
 
 		 803 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  30.27 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30.73 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 		 792 aa  62  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.38 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40.59 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  23.53 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  24.88 
 
 		 804 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  32.14 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  23.15 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  28.42 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 		 775 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 840 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.37 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  24 
 
 		 807 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  23.83 
 
 		 817 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 805 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 806 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  24 
 
 		 807 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  26.76 
 
 		 805 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.82 
 
 		 813 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>