More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2253 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.81 
 
 
217 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  43.87 
 
 
214 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  42.51 
 
 
219 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.17 
 
 
222 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.13 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  41.75 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  38.5 
 
 
222 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.5 
 
 
222 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  42.72 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  41.51 
 
 
224 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  41.04 
 
 
225 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.17 
 
 
226 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.08 
 
 
221 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  39.82 
 
 
222 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  42.11 
 
 
214 aa  148  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  40.57 
 
 
224 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  41.98 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  41.23 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  40.18 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.9 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.73 
 
 
222 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  40.09 
 
 
224 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.32 
 
 
223 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  41.51 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.27 
 
 
220 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.81 
 
 
212 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  40.38 
 
 
234 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  41.98 
 
 
215 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.9 
 
 
204 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  40.38 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  40.95 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.06 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  41.63 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  36.14 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  44.17 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  40.95 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.63 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  35.29 
 
 
220 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  33.97 
 
 
209 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.5 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 
843 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.93 
 
 
828 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  29.93 
 
 
835 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  29.93 
 
 
835 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  43 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 
833 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.09 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  32.38 
 
 
846 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  35.92 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.94 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 
800 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
805 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  30 
 
 
812 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.23 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  34.91 
 
 
807 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
808 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  34.91 
 
 
807 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  35.71 
 
 
805 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
807 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  37.62 
 
 
807 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  32.38 
 
 
808 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  32.74 
 
 
820 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  31.13 
 
 
809 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
806 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.45 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  32.67 
 
 
803 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30.84 
 
 
840 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  33.67 
 
 
803 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.24 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
813 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  32.52 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.89 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  29.33 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 
817 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.84 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  28.07 
 
 
808 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 
804 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.05 
 
 
191 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>