259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3271 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  59.19 
 
 
223 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  58.74 
 
 
223 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  59.82 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  58.3 
 
 
234 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.18 
 
 
231 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.52 
 
 
226 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.45 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  57.85 
 
 
229 aa  231  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.85 
 
 
222 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  52.7 
 
 
225 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  55.2 
 
 
219 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  53.6 
 
 
224 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  52.94 
 
 
222 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  52.25 
 
 
224 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  52.25 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  52.75 
 
 
222 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  51.98 
 
 
223 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  51.4 
 
 
222 aa  214  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.4 
 
 
222 aa  214  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.23 
 
 
221 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  50.44 
 
 
224 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  50.44 
 
 
224 aa  208  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.57 
 
 
223 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  44.09 
 
 
220 aa  201  7e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.3 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  45.1 
 
 
214 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  45.58 
 
 
214 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.51 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.59 
 
 
217 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  43.98 
 
 
216 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  43.46 
 
 
209 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  44.65 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.65 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.65 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  44.17 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  43.26 
 
 
215 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.67 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 
212 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 
204 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  43.94 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  35.62 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  24.75 
 
 
828 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 
835 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  39.84 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 
835 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  24.3 
 
 
843 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  32.08 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 
840 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.31 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  24.35 
 
 
816 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  25.51 
 
 
817 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.5 
 
 
833 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  36.79 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.19 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.99 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  23.81 
 
 
812 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  23.96 
 
 
817 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.31 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.06 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.08 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  25.82 
 
 
802 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  23.79 
 
 
811 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.66 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  40.71 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.64 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  37.96 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  31.36 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  35.64 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  24.24 
 
 
825 aa  58.9  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.56 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 
816 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.68 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  39.18 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1099  hypothetical protein  51.02 
 
 
51 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  24.87 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  37.27 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.12 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  26.32 
 
 
808 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 
829 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  28.46 
 
 
800 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  22.84 
 
 
803 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  25.93 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.61 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  23.38 
 
 
792 aa  55.1  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.89 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  28.5 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  27.81 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  30.71 
 
 
780 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  28.5 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  27.56 
 
 
813 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  30.15 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>