259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0892 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  97.86 
 
 		 229 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  88.03 
 
 		 231 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  61.23 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  61.4 
 
 		 223 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  60.87 
 
 		 226 aa  258  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.01 
 
 		 222 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  57.01 
 
 		 222 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  60.99 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  54.5 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  53.81 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  55.16 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  54.5 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  54.71 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  55.16 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  53.6 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  52.47 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  58.3 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.8 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  51.8 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.58 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.46 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  52 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  51.79 
 
 		 219 aa  221  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.49 
 
 		 222 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  46.67 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  44.14 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.45 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  46.73 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.78 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.95 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.48 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  46.48 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  42.79 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  40.38 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.78 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  38.5 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  39.09 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.93 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.54 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.65 
 
 		 218 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  38.6 
 
 		 167 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 		 828 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.05 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.42 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 812 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  29.13 
 
 		 835 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  29.13 
 
 		 835 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  35.65 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.5 
 
 		 843 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  27.84 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  30.39 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  29.63 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  35.4 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  35.4 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 		 840 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  35.4 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  24.45 
 
 		 817 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.71 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  29.9 
 
 		 800 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.05 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  27.05 
 
 		 774 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 817 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.57 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  22.91 
 
 		 816 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  32.88 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.33 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.9 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  26.48 
 
 		 825 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  28.9 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.9 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.06 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.43 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  31.51 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  28.96 
 
 		 780 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  31.45 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.52 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  30.35 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  24.76 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  25.34 
 
 		 813 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1099  hypothetical protein  61.36 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  24.37 
 
 		 815 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 		 775 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  28.22 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  27.49 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  38.61 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.25 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  25.77 
 
 		 808 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  34.48 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  36.56 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  38.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 816 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  33.98 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 817 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.85 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.93 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  34.62 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>