247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2128 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.77 
 
 
222 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.6 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  46.15 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.63 
 
 
222 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  45.63 
 
 
222 aa  177  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  45.63 
 
 
222 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.13 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  44.88 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.05 
 
 
222 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  43.81 
 
 
239 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  43.56 
 
 
223 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  42.16 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  41.87 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.72 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.05 
 
 
220 aa  161  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  40.89 
 
 
224 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  41.38 
 
 
214 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  41.87 
 
 
223 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  47.39 
 
 
218 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  41.38 
 
 
224 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  42.72 
 
 
214 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  40.39 
 
 
224 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  42.36 
 
 
223 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  40.89 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.92 
 
 
226 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  44.93 
 
 
224 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.72 
 
 
231 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  42.99 
 
 
234 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  37.86 
 
 
220 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.58 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.75 
 
 
222 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  41.75 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  41.75 
 
 
215 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.92 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  41.31 
 
 
229 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.26 
 
 
222 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.42 
 
 
218 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  37.62 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  45.59 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  35.32 
 
 
216 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  36.48 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  32.98 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  28.85 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  32.24 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  33.18 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  34.11 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  36.96 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.12 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  28.71 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.14 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  28.8 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.06 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.78 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  38.78 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
828 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  40.43 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.36 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  40.43 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.94 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
843 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  28 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
835 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  39.36 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.87 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.07 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
835 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  30.5 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  27.67 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  32.71 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 
817 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  24.52 
 
 
825 aa  59.3  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  34.11 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  31.78 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.83 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.78 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  36.73 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.73 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.78 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.59 
 
 
816 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  37.89 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 
840 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.78 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  29.67 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.51 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.84 
 
 
812 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 
817 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  36.27 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  36.26 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  36.17 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.35 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.29 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  36 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>