235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3046 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.44 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.33 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  40.09 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  39.29 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.93 
 
 		 232 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.41 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  38.2 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  39.81 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  38.06 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  37.04 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  51.55 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  37.71 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  31.28 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.86 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.97 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  32.57 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.36 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.36 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.36 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  34.2 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.2 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  34.2 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.2 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.34 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  33.5 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  30.39 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.91 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  31.88 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.88 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.17 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  32.82 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  30.69 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.43 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  30.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  30.61 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.46 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.82 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  31.89 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  31.12 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  30.39 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  30.2 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  29.21 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  28.99 
 
 		 798 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  31.82 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.99 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  29.85 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.17 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.85 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  29.76 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.65 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.86 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  29.29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.37 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  32.35 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 840 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  29.95 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  36.46 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  28.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  27.08 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  25.93 
 
 		 816 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  30.28 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.61 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  31.47 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  34.02 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  27.8 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.74 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  29.05 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.7 
 
 		 828 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  29.3 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  28.96 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  28.06 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  29.61 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  27.65 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  30.09 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.35 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  41.3 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.75 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  28.91 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  27.36 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  28.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  28.29 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  28.92 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>