202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0525 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  46.52 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  49.2 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.6 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.16 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.18 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  37.44 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.2 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.2 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  38.38 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  37.37 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.69 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  38.19 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.19 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.19 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  35.98 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  37.89 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  34.33 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  34 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  37.23 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  34.92 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  36.87 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.99 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  33.5 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.63 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.65 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  33.5 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  33.18 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  33.86 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.49 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.99 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  34.15 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  43.68 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.67 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.02 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.49 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  33.51 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  32.63 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.38 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.72 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  31.22 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  31.87 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.11 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.11 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.57 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  31.77 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  29.57 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  30.1 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  31.63 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  28.88 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.94 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.06 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.57 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  31.35 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.91 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  30.27 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 		 225 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  36.02 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  36.02 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.05 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.88 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  28.88 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.5 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  28.07 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.03 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  34.52 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.5 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.77 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.61 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  31.98 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  35.47 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.35 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  31.66 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  30.73 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  39.08 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  29.89 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.53 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  35.24 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  28.14 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  30.3 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.28 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.62 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  32 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.5 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  28.5 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.77 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>