153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2317 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  63.27 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  63.78 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  63.27 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  62.76 
 
 		 183 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  59.69 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  59.69 
 
 		 185 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  59.18 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  59.18 
 
 		 183 aa  241  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  56.12 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.78 
 
 		 182 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  40.2 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  38.19 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  36.82 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  32.83 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.69 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  36.14 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  34.85 
 
 		 232 aa  101  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  30.94 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  30.61 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.14 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.15 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  29.74 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  29.59 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.59 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  30.05 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  28.72 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  29.79 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  29.44 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  25.5 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  27.96 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  37.72 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.32 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  28.18 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.4 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  27.62 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  40.57 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  27.36 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.36 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  26.88 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  24.88 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.46 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.93 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.93 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.98 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  29.69 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.63 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  25.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  23.19 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25.4 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.11 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  29.03 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  25.4 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  30.97 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.46 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  24.87 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.58 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  42.53 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  42.53 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.73 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  37.62 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.63 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.02 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.63 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.33 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.06 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.58 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  29.47 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  27.57 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  37.93 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  38.1 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.8 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.65 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.08 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>