115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3558 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  79.47 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  75.39 
 
 		 191 aa  308  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  75.39 
 
 		 191 aa  308  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  74.87 
 
 		 191 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 191 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  73.3 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  73.3 
 
 		 191 aa  297  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 		 191 aa  285  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  69.11 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  68.42 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  66.32 
 
 		 192 aa  268  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  67.02 
 
 		 197 aa  258  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.73 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.79 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.14 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.14 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.55 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.14 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.93 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  31.95 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  28.65 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  31.29 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  29.61 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.82 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.06 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.06 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  26.88 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  28.67 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  27.88 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  26.13 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.32 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  25.5 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  24.75 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  24.75 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.75 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.75 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  25 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  21.76 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  24.27 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  24.74 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  23.79 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.71 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  22.96 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  25.38 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.77 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.51 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.44 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  23.17 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  24.59 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  27.27 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  24.47 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.55 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  24.19 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  21.69 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  35.44 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  24.1 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.14 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.53 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  21.38 
 
 		 785 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  21.38 
 
 		 785 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  21.38 
 
 		 785 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.4 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  22.22 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 785 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  21.99 
 
 		 811 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  22.86 
 
 		 783 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  23.81 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  25.51 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  27.52 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  29.67 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  21.38 
 
 		 784 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>