97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0505 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 191 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  73.68 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  73.68 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  74.6 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  72.63 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  72.11 
 
 		 191 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  69.47 
 
 		 191 aa  294  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  71.96 
 
 		 191 aa  293  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  68.95 
 
 		 191 aa  287  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  65.45 
 
 		 192 aa  273  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  68.42 
 
 		 192 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 		 197 aa  269  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.84 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  35.26 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  32.28 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  34.24 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  30.16 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.53 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.53 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.53 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.1 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  32.95 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  30.69 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  30.73 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.42 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  30.51 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.67 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  28.16 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  27.06 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  26.87 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  26.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  28.36 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  28.72 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.47 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  24.72 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.36 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25.74 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.74 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  25.74 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.64 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.74 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.64 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  27.03 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.74 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.37 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  27.32 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  27.72 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.53 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  24.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.01 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  24.47 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  25.13 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  24.29 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  23.16 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  23.78 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  22.63 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.04 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  24.32 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  25.93 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  25.93 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  24.87 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  24.35 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.24 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  24.87 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  23.44 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  30 
 
 		 111 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.93 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  23.81 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  25 
 
 		 229 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.11 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  22.7 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.16 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  23.6 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  30.23 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  31.73 
 
 		 223 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.26 
 
 		 196 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.71 
 
 		 194 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  30.23 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.15 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>