144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3300 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  75.94 
 
 
194 aa  298  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.26 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.86 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  43.72 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  43.65 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  38.38 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.31 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  35.68 
 
 
210 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  38.97 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.47 
 
 
194 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  37.95 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  38.42 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  38.42 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  41.3 
 
 
196 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.93 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.8 
 
 
196 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.93 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.93 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.97 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  38.8 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  41.36 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  40.11 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  38.19 
 
 
217 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  42.41 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.41 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.41 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  37.56 
 
 
220 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  37.44 
 
 
202 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.36 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.16 
 
 
196 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.29 
 
 
214 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  34.44 
 
 
193 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  35.52 
 
 
197 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  34.43 
 
 
197 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.57 
 
 
209 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  36.17 
 
 
207 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  32.83 
 
 
230 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  33.92 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  36.6 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  36.6 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  34.36 
 
 
215 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.5 
 
 
234 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.85 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  39.08 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.26 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.48 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.76 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  35.57 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.76 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.18 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.09 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  32.76 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.61 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  35.08 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  31.82 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.22 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  32.6 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.81 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.31 
 
 
183 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  31.75 
 
 
217 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  31.69 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.15 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  35.92 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  31.15 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  30.91 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  28.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.71 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  27.96 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.29 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  26.01 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  31.69 
 
 
226 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  25.62 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  41.05 
 
 
221 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.59 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  39.47 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.47 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.47 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.06 
 
 
233 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  38.3 
 
 
225 aa  54.3  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  29.26 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.8 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.62 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  24.29 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.28 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.71 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  24.29 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>