More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0361 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
202 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.79 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.55 
 
 
191 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  53.33 
 
 
196 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  45.6 
 
 
200 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.83 
 
 
223 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  38.38 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.5 
 
 
193 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  38 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  37.89 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  42.86 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.09 
 
 
224 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.34 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.1 
 
 
234 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  43.07 
 
 
196 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.36 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.19 
 
 
222 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  38.27 
 
 
194 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  39.58 
 
 
196 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.45 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.87 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  36.08 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.74 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  37.74 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.74 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  37.44 
 
 
192 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  39.47 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.05 
 
 
211 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  38.54 
 
 
210 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  38.65 
 
 
211 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  38.74 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  38.22 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  37.32 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  37.68 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.02 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.02 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  38.05 
 
 
217 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  35.85 
 
 
220 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.75 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  36.67 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  32.49 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  31.96 
 
 
183 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.44 
 
 
183 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.44 
 
 
183 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.98 
 
 
196 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.44 
 
 
183 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  35.53 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  36.98 
 
 
216 aa  98.2  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.55 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.54 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.74 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.52 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.52 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  34.34 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.47 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.47 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  31.47 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  37.23 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  37.23 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  35.43 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.72 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.87 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  31.49 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  40.17 
 
 
111 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  31.15 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.81 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 
840 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.74 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.82 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  29.5 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.32 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  35.61 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  38.46 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  30.6 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.21 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  27.67 
 
 
785 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  30.2 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  31.53 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.4 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  36.89 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  34.69 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 
835 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.36 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
825 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.67 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 
787 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>