178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0591 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  96.17 
 
 
210 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  85.78 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  69.19 
 
 
211 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  70.14 
 
 
211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  68.72 
 
 
211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  68.72 
 
 
211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  68.72 
 
 
211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 
210 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  68.25 
 
 
211 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  68.72 
 
 
210 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  68.25 
 
 
211 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  53.33 
 
 
220 aa  240  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  53.33 
 
 
217 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  52.36 
 
 
217 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  53.33 
 
 
217 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  55.38 
 
 
216 aa  221  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  43.33 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  43.56 
 
 
210 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  42.44 
 
 
200 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.32 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  41.9 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.04 
 
 
209 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  37.44 
 
 
230 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.21 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  42 
 
 
196 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.9 
 
 
222 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  38.57 
 
 
229 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.1 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.82 
 
 
234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.85 
 
 
215 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  35.85 
 
 
215 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  33.5 
 
 
194 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  37.69 
 
 
194 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  37.95 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  42.08 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.68 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.93 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.65 
 
 
202 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  36.95 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.33 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  36.76 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.83 
 
 
196 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.85 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.01 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.85 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  46.85 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  34.63 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.83 
 
 
194 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.47 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.18 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.91 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.43 
 
 
233 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.43 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.35 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  33.66 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  33.66 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.16 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  30.11 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.24 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.24 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.24 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.65 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  45.65 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.21 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.27 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.27 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  33.87 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  32.51 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  30 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.94 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  28.02 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.4 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  44.33 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  34.21 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.5 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.87 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  28.36 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  26.9 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.86 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.76 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.71 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.6 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  37.27 
 
 
111 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  31.31 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.23 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  29.13 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  38.89 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  26.04 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  35.07 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  28.29 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>