More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0318 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  84.91 
 
 
217 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  65.38 
 
 
220 aa  291  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  63.33 
 
 
220 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  62.38 
 
 
220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  62.02 
 
 
220 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  61.06 
 
 
218 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  60.58 
 
 
218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  61.06 
 
 
218 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  60.1 
 
 
218 aa  267  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  58.25 
 
 
218 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  55.5 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  55.5 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  53.85 
 
 
213 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  52.88 
 
 
216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.88 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  50.71 
 
 
216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  49.04 
 
 
212 aa  214  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  35.78 
 
 
220 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.2 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.13 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.11 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.13 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.01 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.6 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  27.84 
 
 
781 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.38 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  29.63 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  42.45 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  30.05 
 
 
808 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.09 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.97 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  29.44 
 
 
804 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  34.62 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  33.15 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
828 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.91 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  41.03 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  28.92 
 
 
816 aa  78.2  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  40.57 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  25.77 
 
 
797 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.8 
 
 
785 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 
802 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  31.34 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.85 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.38 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 
813 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
835 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
843 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
835 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  27.84 
 
 
805 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
785 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
785 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.86 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
785 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  26.63 
 
 
785 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  26.63 
 
 
785 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  26.63 
 
 
785 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
785 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  34.46 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  34.63 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  34.62 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
784 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  26.13 
 
 
785 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 
227 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.74 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 
809 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.24 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  27.27 
 
 
806 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  25.26 
 
 
785 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.66 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 
818 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 
804 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 
804 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 
789 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  29.28 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  29 
 
 
788 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.29 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.8 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.13 
 
 
784 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40.59 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  29.8 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  29 
 
 
788 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.29 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.8 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 
823 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
784 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
784 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  28.93 
 
 
809 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>