220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3807 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  65.8 
 
 		 196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  64.77 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  63.4 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  64.77 
 
 		 197 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  64.25 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  63.73 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  61.66 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  62.69 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  62.69 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  62.69 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.64 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.79 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  42.47 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.92 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  42.39 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  41.36 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  41.49 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  39.69 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.41 
 
 		 224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.18 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.66 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  37.76 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.24 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  37.19 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.7 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  47.32 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  34.98 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.45 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  33.83 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  34.16 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.38 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.83 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  33.83 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.83 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  35.03 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  34.65 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  36.05 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.83 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.83 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.57 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  35.83 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  29.67 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  43.93 
 
 		 111 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.27 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.31 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  40.98 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  36.17 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  34.92 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  34.92 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  43.97 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  47.42 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  41.9 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.26 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.56 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.89 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  31.96 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  33.82 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  31.96 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.3 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.09 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.35 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  42.98 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.63 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.71 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  29.6 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  32.12 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.82 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  43.16 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.62 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  38.46 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  38.05 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.58 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  41.05 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  41.13 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  34.02 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  41.13 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  29.38 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.37 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  38.89 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.32 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.21 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>