219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3243 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
265 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.7 
 
 
233 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.22 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  41.2 
 
 
221 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  39.55 
 
 
226 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  40.71 
 
 
226 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  41.83 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.53 
 
 
224 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  38.21 
 
 
225 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  40.32 
 
 
224 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  37.01 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  32.94 
 
 
213 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.13 
 
 
221 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  33.47 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.2 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.27 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  29.92 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.13 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  42.15 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  43.22 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  30.93 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  30.83 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  42.24 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  32.77 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.48 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  28.27 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  26.58 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  41.86 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.53 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  43.59 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  25.95 
 
 
815 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  36.84 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  36.59 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  44 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  25.32 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  40.8 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.38 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.38 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.09 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
220 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  29.11 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.46 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  31.65 
 
 
196 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.22 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  30.8 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  29.53 
 
 
805 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  33.62 
 
 
214 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  38.6 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.54 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.09 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.61 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.3 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.61 
 
 
196 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  38.64 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 
233 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  43 
 
 
224 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  43.3 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  40.35 
 
 
203 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  37.29 
 
 
216 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  37.07 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  35.33 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  35.59 
 
 
214 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.1 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.52 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 
835 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.83 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 
800 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  35 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  36.11 
 
 
203 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  38.78 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.61 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.02 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25 
 
 
812 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  39 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  33.61 
 
 
833 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  39.58 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  39.6 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  36.59 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.59 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.94 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.59 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  31.97 
 
 
817 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.54 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  39.58 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>