More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0882 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  72.51 
 
 		 213 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  72.64 
 
 		 212 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  72.64 
 
 		 212 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  69.67 
 
 		 216 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  67.14 
 
 		 216 aa  303  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  69.67 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  67.45 
 
 		 212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  59.72 
 
 		 220 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  57.35 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  58.25 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  57.35 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  58.25 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  56.87 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  55.02 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  54.07 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  54.55 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  53.3 
 
 		 218 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  38.3 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  38.78 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.02 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.66 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  35.52 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.95 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  34.18 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.9 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.88 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 843 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 835 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  36.31 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 835 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 		 828 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  34.25 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.88 
 
 		 781 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.97 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.82 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 		 784 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.85 
 
 		 833 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 785 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 785 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  30.85 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 785 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 783 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  29.28 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  26.34 
 
 		 785 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 		 785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  26.88 
 
 		 785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  26.88 
 
 		 785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  26.88 
 
 		 785 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 824 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 		 813 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 		 818 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  32.62 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  25.27 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  26.89 
 
 		 823 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 820 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  26.24 
 
 		 805 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  29.58 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  42.7 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  29 
 
 		 846 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 806 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 812 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  28.64 
 
 		 816 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  26.96 
 
 		 808 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.93 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  37.89 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 		 806 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  28.88 
 
 		 804 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  25.4 
 
 		 800 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  36.68 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.21 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  25.95 
 
 		 805 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  26.24 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  36.28 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  25.74 
 
 		 802 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 805 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  24.62 
 
 		 817 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 		 817 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  31.76 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  25.13 
 
 		 785 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  27.98 
 
 		 811 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 791 aa  65.1  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  25 
 
 		 812 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.1 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>