231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1432 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  70.98 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  52.44 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.3 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  45.91 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.3 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  44.83 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  40.97 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  40.09 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  41.56 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  39.81 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  41.56 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  38.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.14 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  38.36 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.52 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.07 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.51 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.63 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  40.82 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  39.59 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  39.59 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  40.1 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  32.31 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  38.69 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.84 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.76 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  35.5 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  37.19 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  34.85 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  34.85 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.48 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.84 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  34.69 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  32.28 
 
 		 203 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  33.98 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.98 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.65 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.26 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.72 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  38.05 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.39 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  30.62 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  37.72 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  37.39 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  36.28 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  33.85 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.4 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  35.48 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  32.67 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  43.75 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  35.96 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.88 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.8 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  32.2 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.49 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.11 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  31.71 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.71 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  38.05 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.71 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.22 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.22 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  30.63 
 
 		 805 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  30.88 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.85 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.53 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  41.53 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  31.29 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.52 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.82 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  32.09 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  31.15 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.17 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  39.32 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  34.43 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  30.11 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 		 790 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  30.7 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  31.6 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  33.16 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  31.02 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  29.56 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  41.41 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  32.49 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.39 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>