281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0295 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  91.96 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  92 
 
 		 225 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  86.61 
 
 		 224 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  86.16 
 
 		 224 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  85.27 
 
 		 223 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  84.38 
 
 		 224 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  67.41 
 
 		 222 aa  309  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  66.07 
 
 		 222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  63.39 
 
 		 222 aa  294  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  64.06 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  64.06 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  64 
 
 		 221 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  63.3 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.35 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.48 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  56.76 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  56.76 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.66 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.08 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  55.16 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  56 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  54.26 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  54.26 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  47.89 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  48.02 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  53.6 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.29 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  47.29 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.29 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.09 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  45.63 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  38.03 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.57 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.89 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.75 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  46.41 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  40.57 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.49 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.56 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  41.33 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 		 167 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 828 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  37.61 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 812 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 835 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 835 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 843 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  34.13 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  31.96 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  34.13 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  34.13 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  29.26 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  27.23 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 774 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.33 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 775 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  29.32 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  41.67 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  30.94 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 792 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  30.52 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.5 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  22.69 
 
 		 833 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  36.04 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.86 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.67 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  24.34 
 
 		 808 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  28.3 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  33.91 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  28.3 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  23.88 
 
 		 817 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  29.06 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.69 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.59 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 		 813 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  24.02 
 
 		 816 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.97 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  28.18 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  25.26 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  28.1 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.08 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.4 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  27.36 
 
 		 803 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  27.23 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  24.06 
 
 		 807 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  25.77 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  34.69 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  24.06 
 
 		 807 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  24.06 
 
 		 807 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  24.06 
 
 		 807 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.91 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  23.58 
 
 		 805 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>