155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3194 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  44.96 
 
 
220 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  38.98 
 
 
221 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  39.92 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.67 
 
 
233 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.64 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  35.27 
 
 
225 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  41.13 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.06 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  35.52 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  31.3 
 
 
226 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.02 
 
 
233 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  30.86 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  32.4 
 
 
222 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.56 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.28 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  32.89 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  31.76 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.08 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  29.8 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  26.61 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.04 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  27.02 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  29.79 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  26.1 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  31.3 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  28.38 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  28.63 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.31 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  27.87 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  26.61 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.13 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  28.26 
 
 
194 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.21 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.15 
 
 
190 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  26.51 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.97 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  27.35 
 
 
197 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  32.21 
 
 
197 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.87 
 
 
196 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.87 
 
 
196 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 
220 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  31.29 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  28.34 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  28.7 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  28.34 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  27.95 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  28.18 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  28.93 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  24.78 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  29.82 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.39 
 
 
211 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.72 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  25.43 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  34.09 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  25.93 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  29.06 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  27.43 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.97 
 
 
211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.97 
 
 
211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  24.35 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  27.56 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  24.78 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  26.14 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  25.64 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  22.98 
 
 
812 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.83 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.75 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  30.64 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  29.63 
 
 
203 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  26.14 
 
 
211 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.14 
 
 
211 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.14 
 
 
211 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 
805 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.39 
 
 
191 aa  52.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  29.6 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  24.27 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 
790 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  24.27 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.04 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  23.32 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  24.56 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  23.14 
 
 
816 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.79 
 
 
202 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  25.43 
 
 
203 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  26.92 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.14 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.69 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>