261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2198 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  39 
 
 
231 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  35.96 
 
 
231 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  36.68 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  36.18 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.53 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  41.13 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.28 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  38.46 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  44.55 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.09 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.14 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  38.66 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  40 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  26.64 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  37.82 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  37.61 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  39.09 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  38.46 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  34.36 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.86 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  35.9 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.57 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  29.95 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  28.93 
 
 
798 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.74 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.09 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
828 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28 
 
 
843 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 
800 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  30.27 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  35.14 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  39.09 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.27 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
835 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
835 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.3 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  37.27 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  27.86 
 
 
823 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 
792 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.59 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  36.84 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  27.73 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  37.96 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.89 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.25 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  27.41 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  38.46 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.85 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  28 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  28.64 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.85 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.25 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.3 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  35.35 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.67 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.69 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  29.67 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.67 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.12 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.64 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.3 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
812 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 
805 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.72 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.3 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  27.32 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
812 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.72 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  42.11 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  29.8 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.5 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.59 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.59 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  26.23 
 
 
799 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
817 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.67 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.67 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
816 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.95 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  27.01 
 
 
774 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.37 
 
 
816 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  25.74 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  30.96 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  29.29 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  37.19 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.27 
 
 
191 aa  55.5  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>