More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2527 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  92.79 
 
 
222 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  79.28 
 
 
222 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  78.38 
 
 
222 aa  363  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  77.03 
 
 
221 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  67.13 
 
 
223 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  61.71 
 
 
222 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  65.9 
 
 
224 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  66.36 
 
 
224 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  64.06 
 
 
224 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  65.44 
 
 
224 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  63.59 
 
 
224 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  64.09 
 
 
225 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  61.68 
 
 
219 aa  274  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.3 
 
 
223 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.92 
 
 
227 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  54.38 
 
 
223 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  54.38 
 
 
223 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  49.52 
 
 
214 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.45 
 
 
226 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  49.31 
 
 
214 aa  208  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.51 
 
 
231 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  51.8 
 
 
234 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  53.46 
 
 
224 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  51.35 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  49.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  51.4 
 
 
223 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.17 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  49.3 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.63 
 
 
217 aa  177  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  41.46 
 
 
220 aa  175  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.83 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.78 
 
 
212 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  38.5 
 
 
239 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.06 
 
 
204 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  46.7 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
218 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.49 
 
 
209 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.66 
 
 
216 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.43 
 
 
167 aa  95.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  35.53 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  34.08 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  36.84 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.88 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.78 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  25.23 
 
 
828 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.28 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  30.27 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.72 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  25.23 
 
 
835 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25.23 
 
 
843 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  25.23 
 
 
835 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  37.78 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.44 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.85 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  30.88 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 
812 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  35.56 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  38.78 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  32.48 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  24.14 
 
 
810 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 
810 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  36.67 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  26.53 
 
 
817 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  25.12 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  39.56 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  23.11 
 
 
810 aa  58.5  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.67 
 
 
786 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  27.61 
 
 
808 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.9 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  23.15 
 
 
833 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.5 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.04 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
846 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.04 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  33.68 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  35.56 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  26.53 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  35.56 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  37.04 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.11 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.08 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
813 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  26.32 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
811 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  23.67 
 
 
803 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  26.03 
 
 
805 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.96 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  28.02 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.14 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  24.78 
 
 
805 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
807 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>