230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0082 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  92.41 
 
 		 224 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  86.16 
 
 		 224 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  84.38 
 
 		 224 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  85.27 
 
 		 224 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  83.93 
 
 		 223 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  83.11 
 
 		 225 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  67.41 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  67.41 
 
 		 222 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  65.62 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  66.36 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  66.36 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  64.95 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.35 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  60.55 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.15 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  58.04 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  57.59 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.14 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  55.16 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.34 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.44 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  54.26 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  54.71 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  45.59 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  47.76 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  50.44 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.15 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.26 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  48.26 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.26 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  45.54 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  38.97 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.06 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.89 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  46.86 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.73 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.51 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.54 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  39.29 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  36.48 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  36.59 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  36 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.7 
 
 		 828 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  36.59 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 843 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 835 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 835 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  29.3 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  37.96 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  23.53 
 
 		 833 aa  61.6  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.54 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.19 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  32.46 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  29.9 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 		 812 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  31.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  31.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.51 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  26.18 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  32.73 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.44 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 792 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  31.31 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  30.3 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  28.9 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.5 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.84 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  32.73 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 817 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  24.62 
 
 		 775 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  26.87 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.23 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  30.6 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  35.4 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1099  hypothetical protein  52.27 
 
 		 51 aa  53.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  29.17 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.29 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  29.08 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  30.22 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.97 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.43 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  34.07 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  26.16 
 
 		 808 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  23.98 
 
 		 774 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  24.43 
 
 		 810 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.63 
 
 		 813 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  25.88 
 
 		 804 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 788 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.74 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 788 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 788 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>