271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3046 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  75.66 
 
 		 223 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  74.78 
 
 		 223 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  67.26 
 
 		 224 aa  284  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  63 
 
 		 231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  60.87 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  60 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  56.7 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  55.56 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  56 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  56 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  55 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  54.46 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  55.05 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  55.56 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  56.44 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  55.81 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  55.45 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.7 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.45 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  57.52 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.46 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  56.28 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.34 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.87 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  42.92 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  47.09 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  47.47 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.61 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.92 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  44.17 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.78 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  48.78 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  45.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.32 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.2 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  45.27 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  37.93 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.58 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  37.98 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.46 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  42.94 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  37.96 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  37.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  37.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.53 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  26.61 
 
 		 833 aa  68.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  31.72 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  37.74 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.01 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 835 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  40.82 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 835 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 843 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  42.42 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.72 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  37.11 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  39.25 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.33 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  32.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  35.85 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.48 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 817 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.64 
 
 		 840 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.73 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.38 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.29 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  26 
 
 		 810 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.66 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  32.63 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  34.03 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  28.93 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  28.29 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  26.2 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 846 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 810 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.86 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 808 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  31.73 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30.37 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  31.43 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  28.35 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  32.52 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  27.09 
 
 		 816 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  31.43 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.8 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.32 
 
 		 817 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  31.43 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  24.81 
 
 		 812 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.06 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1099  hypothetical protein  50.98 
 
 		 51 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  29.15 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  29.15 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>