214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0034 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  74.65 
 
 		 214 aa  330  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  76.06 
 
 		 222 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  75.59 
 
 		 222 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  75.12 
 
 		 222 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  69.01 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  57.14 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.61 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  48.61 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  48.84 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  48.37 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.13 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.12 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  46.19 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  45.54 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  45.54 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  45.54 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  45.63 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  46.6 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.45 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  45.89 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  44.06 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.23 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  46.58 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  45.66 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.07 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.32 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.93 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.57 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  42.79 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  43.84 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.98 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.75 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  42.79 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  44.1 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  38 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.58 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  40 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.39 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  43.26 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.11 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  36.88 
 
 		 167 aa  88.2  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  40.74 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  40.74 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  40.74 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  42.2 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.85 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  37.61 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  39.64 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.94 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.17 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.66 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  35.83 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  37.07 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  40.74 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.02 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  31.02 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.84 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  27.98 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 828 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  32.54 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.19 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 812 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  29.06 
 
 		 843 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.89 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  29.06 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  30.26 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  26.8 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  29.06 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  33.88 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  37.72 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.72 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  29.95 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  33.06 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  29.38 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  30.1 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  29.9 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.35 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  36.94 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.86 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  34.91 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.45 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  34.58 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  34.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  28.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  37.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.45 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  30.85 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  29 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  34.15 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>