More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2793 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  70.14 
 
 
219 aa  316  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  65.77 
 
 
222 aa  310  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  65.32 
 
 
222 aa  307  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  62.61 
 
 
221 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  63.96 
 
 
222 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  61.71 
 
 
222 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  61.71 
 
 
222 aa  295  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  60.47 
 
 
225 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  59.35 
 
 
224 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  58.88 
 
 
224 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  61.03 
 
 
223 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  59.35 
 
 
224 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  58.41 
 
 
224 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  59.35 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.46 
 
 
223 aa  251  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.31 
 
 
227 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  51.36 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  51.12 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  55.45 
 
 
223 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  48.31 
 
 
214 aa  204  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.34 
 
 
226 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  52.49 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.29 
 
 
231 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  46.19 
 
 
214 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  52.04 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  51.17 
 
 
224 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.77 
 
 
217 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.4 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.91 
 
 
222 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  45.87 
 
 
222 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.87 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  41.78 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  46.23 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  44.17 
 
 
239 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.14 
 
 
218 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.76 
 
 
212 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.16 
 
 
204 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  45.79 
 
 
218 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  41.67 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  39.58 
 
 
216 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 
167 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  39.84 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  38.41 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  38.1 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.95 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.18 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  37.74 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.89 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  35.19 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  28.95 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  24.19 
 
 
828 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  35.64 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  24.32 
 
 
843 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  24.12 
 
 
835 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  24.12 
 
 
835 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  36 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 
792 aa  65.5  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  29.82 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  27.84 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  43.01 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  35 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.69 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  27 
 
 
817 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  22.38 
 
 
812 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  31 
 
 
817 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  28.97 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  42.11 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  23.85 
 
 
813 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.27 
 
 
813 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  29.29 
 
 
846 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  32.21 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  27.09 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  29.35 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  30.62 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  23.66 
 
 
816 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  22.71 
 
 
809 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  28.97 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.75 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  27.75 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.75 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  23.08 
 
 
810 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  32.28 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  32.28 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.43 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.43 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.92 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  23.65 
 
 
816 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  23.11 
 
 
809 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.92 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  23.08 
 
 
810 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 
805 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.29 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  23.15 
 
 
808 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  24.75 
 
 
803 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  35.71 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>