254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0074 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  92.41 
 
 
224 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  86.16 
 
 
224 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  85.27 
 
 
224 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  85.27 
 
 
224 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  85.33 
 
 
225 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  84.38 
 
 
223 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  66.52 
 
 
222 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  66.52 
 
 
222 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  65.18 
 
 
222 aa  294  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  65.44 
 
 
222 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  65.44 
 
 
222 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  64.49 
 
 
221 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.35 
 
 
222 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  61.01 
 
 
219 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.71 
 
 
227 aa  245  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.14 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  56.76 
 
 
223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  55.86 
 
 
223 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.34 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  54.26 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.28 
 
 
226 aa  208  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  53.81 
 
 
224 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  46.57 
 
 
214 aa  207  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  48.51 
 
 
214 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  53.36 
 
 
229 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  50.44 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.03 
 
 
222 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  47.03 
 
 
222 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.72 
 
 
220 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.03 
 
 
222 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  45.54 
 
 
215 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.06 
 
 
212 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.38 
 
 
217 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  38.03 
 
 
220 aa  157  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  47.37 
 
 
218 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.01 
 
 
218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.98 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.41 
 
 
204 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  39.49 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.27 
 
 
216 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.74 
 
 
167 aa  92.8  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  38.4 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  38.1 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  38.4 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.19 
 
 
828 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 
843 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  29.46 
 
 
835 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  29.46 
 
 
835 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  28.8 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  28.72 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
812 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.84 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.53 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.82 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  29.32 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  28.84 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  26.18 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  29.91 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  34.17 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  29.91 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  31.65 
 
 
196 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  30.26 
 
 
196 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  25.64 
 
 
775 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  24.75 
 
 
774 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  28.43 
 
 
792 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.91 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  35.14 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  28.64 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.57 
 
 
786 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  33.03 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.62 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  31.82 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  31.11 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  35.4 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  24.48 
 
 
817 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.65 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  32.46 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.43 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  28.65 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.77 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  22.33 
 
 
833 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  26.94 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  34 
 
 
220 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 
813 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  30.35 
 
 
202 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  21.43 
 
 
808 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  25.34 
 
 
810 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
793 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  26.88 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  25.55 
 
 
804 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.15 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.02 
 
 
786 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  31.86 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  27.27 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  28.43 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>