More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2046 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  34.52 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.31 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 
792 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 
823 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 
846 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  25.89 
 
 
817 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  26.54 
 
 
840 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 
819 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  38.71 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.57 
 
 
823 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.68 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  31.68 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  31.68 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  23.7 
 
 
816 aa  72.4  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
816 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  29.22 
 
 
814 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.14 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
780 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  26.64 
 
 
817 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  27.65 
 
 
817 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  39.6 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  40.38 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  28.04 
 
 
809 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 
843 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 
898 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  31.66 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  30.64 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 
828 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 
856 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.17 
 
 
833 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  24.3 
 
 
812 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 
835 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 
835 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  23.45 
 
 
815 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 
805 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  24.53 
 
 
829 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  26.05 
 
 
802 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  27.36 
 
 
810 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  26.05 
 
 
802 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 
825 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 
788 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  36.54 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.8 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 
788 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  26.19 
 
 
812 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  36.54 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  27.65 
 
 
772 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  26.54 
 
 
810 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  26.79 
 
 
806 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  31.79 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  38.74 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  25.96 
 
 
810 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
816 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  24.89 
 
 
825 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  25.79 
 
 
800 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  25.12 
 
 
803 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  25.57 
 
 
817 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  25.59 
 
 
804 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  25.59 
 
 
804 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  25.35 
 
 
810 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 
815 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  23.22 
 
 
817 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 
811 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  23.96 
 
 
810 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  24.88 
 
 
798 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  25 
 
 
816 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  25 
 
 
816 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 
796 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  24.88 
 
 
798 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  31.79 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 
802 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 
783 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  26.79 
 
 
798 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  21.9 
 
 
813 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  23.92 
 
 
798 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  23.92 
 
 
798 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  25.71 
 
 
797 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  34.85 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  27.48 
 
 
802 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.22 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  26.17 
 
 
880 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  24.17 
 
 
803 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.94 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  26.41 
 
 
797 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  25.35 
 
 
790 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  25.59 
 
 
785 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  24.56 
 
 
772 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  25.84 
 
 
782 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  30.89 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
820 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  25.12 
 
 
823 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  28.31 
 
 
804 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  21.86 
 
 
775 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
785 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>