294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3774 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  97.76 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  74.78 
 
 
226 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  73.21 
 
 
224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  63.39 
 
 
231 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  61.23 
 
 
234 aa  263  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  58.82 
 
 
223 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.9 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  60.35 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  59.36 
 
 
222 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  58.56 
 
 
224 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  56.76 
 
 
224 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  56.76 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  56.31 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  58.04 
 
 
224 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  56.76 
 
 
224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  58.74 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  56.4 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.47 
 
 
223 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  54.38 
 
 
222 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.38 
 
 
222 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  54.79 
 
 
222 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.34 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.66 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.12 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  50 
 
 
214 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.8 
 
 
220 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  43.12 
 
 
220 aa  188  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  47.8 
 
 
214 aa  184  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  50 
 
 
222 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  48.17 
 
 
222 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.25 
 
 
222 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  46.58 
 
 
215 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.87 
 
 
217 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.79 
 
 
212 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.75 
 
 
239 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  39.6 
 
 
209 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  47.24 
 
 
218 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  40.1 
 
 
216 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.09 
 
 
218 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.8 
 
 
204 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  39.38 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.68 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  37.74 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.77 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  37.74 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  37.74 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 
817 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  30.35 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
828 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.79 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  39.62 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 
835 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 
835 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.45 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  32.06 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.88 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.58 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  32.58 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  30 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  28.71 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  29.73 
 
 
843 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  34.38 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.61 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  29.19 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  29.19 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.97 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40.62 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  31.05 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.74 
 
 
833 aa  58.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  27.69 
 
 
196 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.86 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  26.24 
 
 
810 aa  58.2  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  27.27 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  27.5 
 
 
805 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.29 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  27.18 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.58 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  25 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  29.58 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  24.87 
 
 
805 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.58 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  24.87 
 
 
807 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  25.38 
 
 
808 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  24.87 
 
 
807 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.72 
 
 
786 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30.53 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  32.76 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  29.17 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  35.16 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1099  hypothetical protein  55.56 
 
 
51 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  26.26 
 
 
816 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>