205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0140 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  99.55 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  94.14 
 
 
222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  75.23 
 
 
214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  74.3 
 
 
214 aa  322  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  75.59 
 
 
215 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  55.56 
 
 
212 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  49.32 
 
 
222 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.08 
 
 
222 aa  207  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  49.08 
 
 
222 aa  207  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.08 
 
 
221 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  49.52 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.28 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  48.02 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.91 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  47.03 
 
 
224 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  47.03 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  48.77 
 
 
225 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  47.29 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  46.48 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  47.14 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.87 
 
 
222 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  45.54 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  50 
 
 
223 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  50 
 
 
223 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.2 
 
 
220 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.09 
 
 
223 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.78 
 
 
226 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  46.95 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.97 
 
 
231 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  45.91 
 
 
224 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  40.1 
 
 
220 aa  158  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.75 
 
 
217 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  46.48 
 
 
229 aa  154  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.29 
 
 
218 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.63 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.76 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  44.65 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.56 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  36.87 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.02 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  40 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  34.59 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.04 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  33.68 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  37.04 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  40.54 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  41.51 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  42.59 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.09 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  38.68 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.72 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  33.96 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  36.51 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  39.82 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  36.51 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  35.48 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.81 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  38.14 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  32.31 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  29.65 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  29.65 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  24.37 
 
 
812 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  29.65 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  31.55 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.02 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  23.11 
 
 
833 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.73 
 
 
193 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.68 
 
 
216 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  34.26 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  34.68 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 
828 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  33.64 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  38.53 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.35 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.21 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.87 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.62 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  27.5 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.21 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.59 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  29.02 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25.41 
 
 
843 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.88 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.05 
 
 
835 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.05 
 
 
835 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  36.96 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  28.71 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  28.34 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  31.43 
 
 
203 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  36.45 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  30.48 
 
 
772 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 
808 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  26.23 
 
 
846 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.28 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.3 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>