230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2370 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  56.22 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  55.81 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  57.14 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  56.94 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  55.56 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  55.56 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.75 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.98 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  44.06 
 
 		 224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  43.56 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  44.06 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  42.57 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  42.86 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  43.66 
 
 		 222 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  42.25 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.78 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  41.78 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.29 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  42.08 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  42.08 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.19 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  40.89 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  42.79 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  42.33 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.76 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.92 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  43.98 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.58 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  39.81 
 
 		 239 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.2 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.19 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  41.78 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  43.87 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  36.82 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  41.31 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.16 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.42 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40.3 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  42.86 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  35.81 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.27 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  41.07 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  42.11 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  30.93 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  40.38 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  38.32 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  39.25 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  39.25 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.74 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  37.5 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  37.04 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  37.86 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  36.75 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  31.25 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  38.46 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.28 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  38.46 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  38.46 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  40.38 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.81 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  38.89 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.65 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.47 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  40.38 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  28.43 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  36.89 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  42.16 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.98 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  37.7 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  28.89 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.12 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  29.59 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.71 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  31.47 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.47 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  34.04 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.05 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.87 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.9 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  35.04 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.88 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.32 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.96 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  36.94 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.33 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.96 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  34.65 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.2 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.13 
 
 		 812 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>