170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3710 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 218 aa  433  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  48.72 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.39 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  46.12 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  47.37 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  46.86 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  48.53 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  46.86 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  46.41 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.6 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  45.93 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  45.24 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.73 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  46.7 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.7 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  42.08 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.79 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  43.52 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  45.02 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.78 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  44.76 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  47.24 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.2 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  46.46 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.45 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.16 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  44.71 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.29 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.87 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.96 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  41.75 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  42.05 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.27 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  40 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.1 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  44.93 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  38.62 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  44.28 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.06 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  43.94 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  39.87 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  35.03 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  35.07 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.57 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  32.58 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  27.85 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  31.48 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.32 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 805 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.93 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.06 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  34.65 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  35.96 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  35.96 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  35.96 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  28.38 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  26.4 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.16 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  37.36 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.14 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.9 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.07 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.81 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.6 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  28.57 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  33.33 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  32.29 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  26.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  37.63 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  32.8 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.12 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.37 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  32.41 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  27.32 
 
 		 840 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.74 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  36.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  29.73 
 
 		 800 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  33.66 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  35.96 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  35.63 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  30.51 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  23.15 
 
 		 808 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.56 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>