223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1983 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  59.64 
 
 
223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  59.38 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  58.74 
 
 
219 aa  267  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  58.48 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  58.22 
 
 
225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  61.43 
 
 
222 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.46 
 
 
222 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  60.09 
 
 
222 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.3 
 
 
222 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  58.3 
 
 
222 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  57.14 
 
 
224 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  57.85 
 
 
222 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.33 
 
 
221 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  57.14 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  57.14 
 
 
224 aa  251  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  57.47 
 
 
223 aa  247  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  57.47 
 
 
223 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.7 
 
 
226 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  55.46 
 
 
234 aa  224  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.31 
 
 
231 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  53.6 
 
 
224 aa  217  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.12 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  54.15 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  51.57 
 
 
223 aa  198  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.6 
 
 
217 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  48.06 
 
 
214 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  48.26 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  40.37 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  47.09 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.19 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.09 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.76 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  47.32 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.55 
 
 
218 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  39.32 
 
 
239 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.23 
 
 
209 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.19 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.49 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.16 
 
 
218 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.94 
 
 
216 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 
167 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  39.09 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  32.26 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  34.62 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  34.62 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.86 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  30.89 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.54 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
828 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  27.82 
 
 
843 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.07 
 
 
835 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.07 
 
 
835 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.59 
 
 
833 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  37.17 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 
792 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  25.13 
 
 
816 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  27.1 
 
 
825 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.9 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.86 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.66 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  34 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  33 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  34 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  35.58 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  33 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  34 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 
817 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  28.23 
 
 
808 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  28.91 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  31.43 
 
 
780 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.16 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 
840 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  32.09 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.62 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  28.22 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  31.68 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
807 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  24.63 
 
 
805 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
807 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  24.52 
 
 
804 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  24.39 
 
 
803 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
806 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  24.63 
 
 
807 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  24.63 
 
 
807 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
805 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  27.32 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  39.39 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.68 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  28 
 
 
846 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  24.63 
 
 
808 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>