104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3375 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  43.59 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  38.5 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  34.13 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.85 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.15 
 
 		 182 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.08 
 
 		 183 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.47 
 
 		 185 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.98 
 
 		 185 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  34.39 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  32.81 
 
 		 183 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.29 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.29 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.29 
 
 		 183 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  32.22 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.8 
 
 		 183 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  31.52 
 
 		 171 aa  88.2  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.95 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  30.65 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  31.94 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.36 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.13 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  30.73 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  29.5 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  27.96 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  27.32 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  27.75 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  27.98 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  26.04 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.45 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  25.4 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  24.26 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.26 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  25.13 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  25.25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.4 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.19 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  24.5 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.69 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.23 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.23 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  26 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  24.34 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  25.77 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.77 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  23.62 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.77 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  25.26 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.26 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.26 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  24.74 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  22.11 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.73 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.06 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  23.89 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  25.14 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  25.14 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  35.51 
 
 		 111 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.13 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  21.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  22.63 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  31.19 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  24.35 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  31.19 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  21.11 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.18 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.69 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  33.65 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.71 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  21.93 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  23.83 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  32.69 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.07 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  34.78 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  51.22 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.63 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  52.63 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  52.63 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  22 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  25.12 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  25.13 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  22.35 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  22.35 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  21.79 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  54.76 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  32.97 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>