82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0548 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  100 
 
 
197 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  76.44 
 
 
191 aa  304  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 
191 aa  304  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  72.25 
 
 
192 aa  291  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 
191 aa  288  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  68.42 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 
191 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 
191 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  68.06 
 
 
191 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  67.54 
 
 
191 aa  280  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  67.54 
 
 
191 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  67.54 
 
 
191 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  67.02 
 
 
191 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  66.49 
 
 
191 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  66.49 
 
 
191 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  67.02 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  31.05 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.86 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.86 
 
 
185 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  27.89 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  27.89 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  31.65 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.34 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.29 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.29 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.29 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  30.29 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.31 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  29.82 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.13 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.68 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.68 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  24.44 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.14 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  28.76 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  26.87 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.47 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  22.28 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.16 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  25.37 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  24.02 
 
 
229 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  22.77 
 
 
220 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  22.71 
 
 
230 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  24.04 
 
 
211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  24.04 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  22.11 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.04 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.04 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  21.47 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  22.92 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  25.28 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.56 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.15 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.15 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  21.67 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.32 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  22.12 
 
 
210 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  22.6 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  25 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  24.24 
 
 
196 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  22.05 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  22.4 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  22.58 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  22.55 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.71 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  21.46 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.36 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  20.9 
 
 
223 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  28.18 
 
 
111 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  23.76 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  23.04 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.02 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  23.08 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  22.28 
 
 
229 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>