63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0444 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  100 
 
 
191 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  98.95 
 
 
191 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  98.95 
 
 
191 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  97.91 
 
 
191 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  89.01 
 
 
191 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  88.48 
 
 
191 aa  358  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  74.74 
 
 
192 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  73.3 
 
 
191 aa  309  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  73.82 
 
 
192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  73.3 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  72.11 
 
 
191 aa  296  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  71.05 
 
 
192 aa  289  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  66.49 
 
 
197 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.37 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
183 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.49 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  29.48 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.48 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.48 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.48 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  27.51 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.32 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.02 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  26.46 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  24.16 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.2 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  22.62 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.82 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  25.27 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  27.72 
 
 
229 aa  51.2  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  22.45 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  21.64 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  22.11 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  23.83 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  25.43 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.78 
 
 
224 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  22.28 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  24.62 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.22 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  23.53 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  21.81 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  22.95 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.45 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.45 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  21.79 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  19.69 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.45 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.45 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  23.45 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  21.98 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25.68 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  20.21 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.76 
 
 
211 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>