88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2781 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  42.29 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  38.5 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  36.41 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.72 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.72 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.72 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  32.1 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.89 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.89 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.1 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.72 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.86 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.74 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  32.91 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  30.25 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.17 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.72 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  29.82 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  28.65 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.61 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  28.98 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  31.98 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.75 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  29.3 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  28.34 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  24.72 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  26.62 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  26.01 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  24.72 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  25.44 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  25.28 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  24.72 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  24.16 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  24.72 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.26 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  27.65 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  24.16 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  23.86 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  28 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  23.53 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  24.43 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.22 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  23.53 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.82 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  24.73 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  21.76 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  24.18 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.18 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.18 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.18 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.73 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.73 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  24.73 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.29 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  24.18 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  24.58 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  22.99 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  23.64 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.92 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  22.35 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  29.32 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.32 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  32.99 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  22.45 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  25.6 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  25.6 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.03 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.26 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  25.68 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.59 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.26 
 
 		 196 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30 
 
 		 196 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  22.78 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>