66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3349 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  75.79 
 
 		 191 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 		 191 aa  298  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  73.54 
 
 		 191 aa  297  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  72.11 
 
 		 191 aa  295  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  72.11 
 
 		 191 aa  294  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  72.11 
 
 		 191 aa  294  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  72.63 
 
 		 191 aa  293  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  71.05 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  71.05 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  70.53 
 
 		 191 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  71.05 
 
 		 191 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  68.59 
 
 		 192 aa  283  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  72.25 
 
 		 197 aa  277  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  65.45 
 
 		 191 aa  273  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  66.32 
 
 		 192 aa  268  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.1 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.18 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.18 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.37 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.68 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  30.27 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  30.64 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.64 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.64 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.64 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  25.93 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  27.51 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.06 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.96 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.27 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.76 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  24.43 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  21.97 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  23.12 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  25.91 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.86 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  25.99 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  22.11 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  23.12 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.06 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  23.2 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.92 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  21.43 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  21.11 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  22.28 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  27.4 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  24.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.17 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.17 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.14 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  25.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.21 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  21.05 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  21.24 
 
 		 210 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>