94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1475 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  43.59 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  42.29 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  41.03 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  34.72 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.14 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.5 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.84 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  36.42 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.84 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.26 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.84 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.68 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.68 
 
 		 185 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  35.26 
 
 		 184 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  34.68 
 
 		 183 aa  98.6  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  34.71 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  32.95 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  34.55 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  32.46 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  29.61 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  28.26 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  29.89 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.81 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.34 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  30.6 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.88 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  26.37 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  26.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.09 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  31.28 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  29.1 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  30.81 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  26.4 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  26.46 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.77 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.23 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  29.23 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.23 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  26.73 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  27.27 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  29.73 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  25.76 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.08 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.08 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.8 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.38 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  25.99 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.05 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  27.37 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  29.51 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  24.47 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.51 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  26.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  24.35 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.49 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  28.28 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  28.97 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.97 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.06 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.96 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  25.13 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  27.22 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.57 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  26.26 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  26.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  32.11 
 
 		 111 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.12 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  26.56 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.6 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.26 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  24.6 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.67 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.53 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  32.89 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.34 
 
 		 209 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>