122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5613 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  41.35 
 
 
211 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  41.18 
 
 
213 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  27.94 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  28.85 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  25.96 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.64 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.5 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  25 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.14 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  29.74 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.92 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  29.21 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  29.21 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.19 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  34.45 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  27.27 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  29.03 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.43 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.77 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  35.9 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  32.73 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  23.81 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  27.13 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.17 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  53.66 
 
 
232 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  27.62 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.56 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  29.57 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.11 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  26.44 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  30.21 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  29.63 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.72 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.78 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  30.21 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  28.19 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  25.97 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  29.17 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  36.67 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  28.06 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.07 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  26.67 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  32.89 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 
220 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  23.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  24.15 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.91 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.43 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.46 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.92 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.57 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.85 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  46.15 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.19 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.16 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.13 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  41.67 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.21 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  27.5 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  45.24 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  26.21 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  29.26 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.58 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.84 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  40.38 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  31.31 
 
 
265 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  23.08 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.35 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  36 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  42.55 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.43 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  44.19 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  31.82 
 
 
111 aa  44.7  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  40.82 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.52 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.52 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  40.91 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.14 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.14 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.14 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  48.65 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  32.14 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>