71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0518 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  100 
 
 
191 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  91.1 
 
 
191 aa  366  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  89.53 
 
 
191 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  88.48 
 
 
191 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  74.21 
 
 
192 aa  305  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  75.92 
 
 
191 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  72.77 
 
 
191 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  73.3 
 
 
192 aa  297  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  73.54 
 
 
192 aa  297  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  71.96 
 
 
191 aa  293  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  66.49 
 
 
197 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 
183 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.1 
 
 
183 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  30.65 
 
 
188 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  87.8  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  31.79 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.79 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.79 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.79 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.64 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.79 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.27 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  24.72 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  29.14 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.14 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  24.12 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.23 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  26.02 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  24.62 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  22.7 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.47 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  24.87 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  23.83 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  23.66 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  23.83 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  24.75 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  23.71 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  24 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.43 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.32 
 
 
211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  22.12 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  22.4 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.12 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  21.63 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  23.44 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  23.44 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  22.53 
 
 
196 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.34 
 
 
224 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  23.44 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  29.55 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  26.35 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  26.35 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>