56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A2059 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A2059  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
113 aa  235  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0088  type 4 pili biogenesis protein  99.12 
 
 
115 aa  233  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  39.08 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0650  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1503  hypothetical protein  41.25 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1480  hypothetical protein  41.25 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1904  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.58 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.23 
 
 
261 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0680  type 4 fimbrial biogenesis protein  33.33 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581719  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.25 
 
 
262 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.1 
 
 
262 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  34.44 
 
 
260 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2654  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.58 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.44 
 
 
261 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1227  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.58 
 
 
262 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023902  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2367  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  33.33 
 
 
262 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000700104  normal  0.549255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3314  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  32.58 
 
 
262 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1542  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.86 
 
 
262 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1297  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.276388  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1226  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0380935  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
252 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  37.5 
 
 
263 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  36.84 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  33.33 
 
 
252 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40310  type IV pilus biogenesis protein PilF  39.68 
 
 
252 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  34.88 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  31.07 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 
262 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  33.72 
 
 
252 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.22 
 
 
332 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02493  hypothetical protein  34.09 
 
 
253 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.16 
 
 
266 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3392  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.4 
 
 
266 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0592  TPR repeat-containing pilus assembly protein PilF  38.16 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83159  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4254  lysM domain-containing protein  38.89 
 
 
524 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.84 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4327  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.48 
 
 
253 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813272  hitchhiker  0.000000000191123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
3145 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  34.83 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
377 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3502  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.87 
 
 
253 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
266 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1197  fimbrial biogenesis and twitching motility protein  31.33 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  40.43 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02983  ATP-dependent protease La  32.81 
 
 
809 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00208912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
718 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.77 
 
 
795 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2739  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.86 
 
 
248 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1790  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
241 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1658  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.59 
 
 
261 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>