More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1269 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  64.44 
 
 		 527 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  88.31 
 
 		 545 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  88.91 
 
 		 523 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 516 aa  1034    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  85.47 
 
 		 510 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  64.61 
 
 		 539 aa  631  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  60.16 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.72 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  58.72 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  57.23 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  57.85 
 
 		 522 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  45.38 
 
 		 498 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.07 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  44.66 
 
 		 521 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  41.7 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  41.48 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  42.66 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  40.29 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  42.86 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  41.87 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  44.2 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.47 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 507 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  42.06 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.99 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.64 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.54 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  41.47 
 
 		 504 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 504 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  40.36 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.81 
 
 		 522 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  41.82 
 
 		 520 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.55 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.72 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.1 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  39.05 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 		 527 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  40 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.38 
 
 		 524 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.38 
 
 		 524 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.38 
 
 		 524 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.37 
 
 		 500 aa  346  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.64 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.6 
 
 		 861 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.2 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  40.96 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  40.61 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.02 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  37.33 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.51 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.47 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.16 
 
 		 517 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.38 
 
 		 495 aa  339  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.08 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.28 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 517 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  40 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  39.69 
 
 		 515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  41.87 
 
 		 507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.11 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  38.2 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.46 
 
 		 514 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  41.84 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.07 
 
 		 499 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.92 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.39 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.49 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.26 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.11 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  39.6 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.73 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  39.78 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.9 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.19 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>