More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4370 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  100 
 
 		 520 aa  1051    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  59 
 
 		 527 aa  591  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  57.83 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  58.19 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.43 
 
 		 545 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  58.15 
 
 		 528 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  59.64 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  56.83 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  56.09 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.23 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  46.09 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  46.29 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.23 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.35 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  44.18 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  46.69 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  42.04 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  39.4 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  41.33 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.76 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.57 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  41.85 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 504 aa  362  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  38.79 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 504 aa  356  5.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.75 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.31 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  40.12 
 
 		 507 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  40.68 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  39.73 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.68 
 
 		 499 aa  346  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  40.46 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  39.46 
 
 		 504 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.18 
 
 		 517 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.61 
 
 		 498 aa  339  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 517 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 494 aa  339  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 517 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 517 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.65 
 
 		 506 aa  339  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.99 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.42 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.06 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  37.35 
 
 		 509 aa  337  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  37.27 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 517 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  37.85 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  38.58 
 
 		 517 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.8 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  37.28 
 
 		 514 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  35.98 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  38.39 
 
 		 517 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 494 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.15 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.67 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  35.77 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  36.64 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.45 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.03 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.53 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  35.11 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  38 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.8 
 
 		 497 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  38 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  38.4 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.37 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  38.4 
 
 		 503 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  39.55 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.37 
 
 		 499 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.37 
 
 		 499 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  38.17 
 
 		 517 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  38 
 
 		 517 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 494 aa  329  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  36.6 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.21 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  36.27 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 508 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.47 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  35.27 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  35.27 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  36.33 
 
 		 522 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>