More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0031 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  100 
 
 		 491 aa  998    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  55.33 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  54.71 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  47.34 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  44.58 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  44.31 
 
 		 520 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  44.38 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  44.6 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  44.99 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  41.31 
 
 		 521 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  41.77 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  41.82 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  39.4 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  41.48 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.29 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  38.76 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  39.62 
 
 		 527 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  39.46 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  38.62 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  39.22 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  39.22 
 
 		 497 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.55 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  38.76 
 
 		 522 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  38.91 
 
 		 511 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  39.29 
 
 		 539 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  38.3 
 
 		 498 aa  346  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.74 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.19 
 
 		 501 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  38.87 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  39.84 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.03 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  36.86 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.21 
 
 		 519 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.32 
 
 		 511 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  37.53 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  38.41 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.83 
 
 		 496 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.71 
 
 		 503 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  37.89 
 
 		 519 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  35.96 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  37.29 
 
 		 492 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.31 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  36.71 
 
 		 861 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 504 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  35.85 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  36.91 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.42 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 		 535 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.24 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  38.61 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  36.68 
 
 		 514 aa  326  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.16 
 
 		 517 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.01 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  36.53 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  36.21 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.01 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.95 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  35.44 
 
 		 522 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 499 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  35.86 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  37.26 
 
 		 514 aa  323  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 515 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 515 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 517 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 517 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 517 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  35.55 
 
 		 507 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  37.74 
 
 		 520 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  36.22 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  36.22 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.1 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  36.22 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2114  ABC transporter related  37.58 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  35.76 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.63 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  36.59 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.47 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  35.91 
 
 		 517 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  36.9 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  37.35 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>