More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4062 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  66.47 
 
 
528 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  65.35 
 
 
527 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  100 
 
 
522 aa  1048    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  58.19 
 
 
520 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  58.85 
 
 
510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  58.25 
 
 
523 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  59.84 
 
 
539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.46 
 
 
545 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.62 
 
 
516 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  53.51 
 
 
525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.51 
 
 
525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  47.23 
 
 
497 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  43.28 
 
 
500 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  47.04 
 
 
497 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  45.19 
 
 
499 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  47.02 
 
 
497 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.74 
 
 
498 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
504 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  42.83 
 
 
504 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  40.2 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 
504 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
499 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  41.39 
 
 
504 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  40.76 
 
 
504 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  40.52 
 
 
508 aa  352  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  38.76 
 
 
491 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
517 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.93 
 
 
495 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  41.68 
 
 
498 aa  346  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.71 
 
 
517 aa  346  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
507 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  42.18 
 
 
521 aa  345  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39.53 
 
 
517 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  39.53 
 
 
517 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  41.68 
 
 
520 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  39.65 
 
 
517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.88 
 
 
506 aa  343  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39.53 
 
 
517 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.48 
 
 
507 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  39.46 
 
 
517 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.48 
 
 
507 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
501 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.46 
 
 
501 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.8 
 
 
508 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  37.84 
 
 
500 aa  339  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.28 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.12 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  39.65 
 
 
517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.01 
 
 
519 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
517 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.2 
 
 
499 aa  337  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 
517 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 
517 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  40.86 
 
 
507 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.66 
 
 
501 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.04 
 
 
512 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.22 
 
 
495 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  38.27 
 
 
523 aa  333  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
510 aa  333  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.04 
 
 
505 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.68 
 
 
506 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.11 
 
 
499 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  41.32 
 
 
499 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39 
 
 
501 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.88 
 
 
511 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  38.89 
 
 
516 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  35.31 
 
 
505 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.49 
 
 
518 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.11 
 
 
509 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.08 
 
 
512 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  35.83 
 
 
520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  35.38 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.48 
 
 
504 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
497 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.42 
 
 
511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 
506 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.92 
 
 
524 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.92 
 
 
524 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.19 
 
 
522 aa  326  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  37.11 
 
 
514 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  37.55 
 
 
518 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.48 
 
 
527 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.13 
 
 
508 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 
499 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  36.17 
 
 
511 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.97 
 
 
511 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.51 
 
 
499 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.02 
 
 
512 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  34.94 
 
 
495 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  37.21 
 
 
496 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
501 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
499 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.07 
 
 
496 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.5 
 
 
495 aa  323  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>