More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0346 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 494 aa  1012    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.8 
 
 		 494 aa  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 494 aa  1012    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  63.08 
 
 		 499 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  60.65 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  57.2 
 
 		 491 aa  588  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 507 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.88 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  51.02 
 
 		 520 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  48.68 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  47.68 
 
 		 508 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  47.75 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  47.01 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  47.98 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  45.13 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  44.38 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.42 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  41.41 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.18 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  40.12 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  39.84 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.69 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  42.51 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  41.53 
 
 		 520 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  38.65 
 
 		 498 aa  362  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  42.91 
 
 		 539 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  40.7 
 
 		 528 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.88 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.08 
 
 		 495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.11 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.12 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.04 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 497 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  41.01 
 
 		 497 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 507 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.96 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  41.01 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  37.25 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.17 
 
 		 502 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.91 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.91 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.41 
 
 		 502 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.1 
 
 		 507 aa  349  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.1 
 
 		 507 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  36.71 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.23 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.31 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.96 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.47 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.29 
 
 		 511 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 		 512 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  41.49 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.5 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.18 
 
 		 505 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.08 
 
 		 503 aa  346  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  39.16 
 
 		 510 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.44 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  36.16 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  36.16 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  42.63 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  37.55 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  37.73 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  37.55 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  39.52 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.04 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  37.58 
 
 		 514 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.2 
 
 		 513 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 507 aa  342  7e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.31 
 
 		 514 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  39.71 
 
 		 518 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.92 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.57 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.51 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.21 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  38.66 
 
 		 517 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  38.54 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.41 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.68 
 
 		 506 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2114  ABC transporter related  38.45 
 
 		 504 aa  339  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.87 
 
 		 511 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.45 
 
 		 861 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  38.97 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  39.25 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.17 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.66 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  40.17 
 
 		 518 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.57 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 517 aa  336  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 501 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  37.42 
 
 		 506 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>