More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3560 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  100 
 
 		 520 aa  1031    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  62.57 
 
 		 504 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  61.98 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  62.45 
 
 		 508 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  55.98 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  51.24 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  50.71 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  49.8 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  44.31 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  47.85 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  46.09 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  44.77 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.18 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  46.47 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.08 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.19 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.55 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  44.42 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.98 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  46.96 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.53 
 
 		 861 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  46.96 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  43.82 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  39.47 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.82 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  43.16 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.07 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  42.83 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  47.59 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.32 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.42 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.59 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  44.88 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.33 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 		 516 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 497 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.75 
 
 		 500 aa  359  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  40.13 
 
 		 501 aa  358  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  43.33 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.82 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  42.06 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.29 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.8 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.46 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.11 
 
 		 513 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.91 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.18 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.17 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  39.39 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.83 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.17 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  39.27 
 
 		 511 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.31 
 
 		 514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.29 
 
 		 501 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  41.41 
 
 		 518 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  39.18 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.5 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  44.3 
 
 		 509 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  39.18 
 
 		 516 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  44.3 
 
 		 516 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.96 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  39.41 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  38.62 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  39.41 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  40.93 
 
 		 528 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.46 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  42.8 
 
 		 527 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  39.2 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  39.2 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 517 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.1 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.61 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.79 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.2 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  39.2 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  39.2 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  43.57 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  41.72 
 
 		 522 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>