More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2301 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  100 
 
 		 521 aa  1049    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  64.8 
 
 		 500 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  63.65 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  63.86 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  64.06 
 
 		 497 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  47.14 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  49.48 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  43.78 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  43.52 
 
 		 523 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  41.31 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.27 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  42.6 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  42.04 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  46.36 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  45.13 
 
 		 527 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  44.33 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  44.09 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  45.45 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  44.56 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  44.63 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  43.55 
 
 		 504 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 504 aa  362  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  39.88 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.55 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  36.33 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.06 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.21 
 
 		 524 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.06 
 
 		 524 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.06 
 
 		 524 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.01 
 
 		 524 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.01 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.59 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 507 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 505 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.24 
 
 		 518 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  38.61 
 
 		 516 aa  349  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  44.04 
 
 		 499 aa  349  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  39.39 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  41.98 
 
 		 498 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  39.01 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.98 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.79 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.79 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  42.18 
 
 		 522 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.24 
 
 		 495 aa  343  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  36.74 
 
 		 512 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.28 
 
 		 511 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.19 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.19 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  40.21 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  39.39 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.49 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.19 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  37.42 
 
 		 515 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.41 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.07 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.13 
 
 		 514 aa  339  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  38.27 
 
 		 502 aa  339  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  38.35 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.71 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  36.73 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.44 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.41 
 
 		 513 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  38.27 
 
 		 521 aa  336  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.12 
 
 		 503 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.71 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 505 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  39.37 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 500 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  35.95 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.09 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.56 
 
 		 496 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 507 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  39.24 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  35.74 
 
 		 493 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  36.86 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  37.88 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 		 523 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.92 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.23 
 
 		 511 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  39.76 
 
 		 504 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 517 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>